PCR 直接定序的品質檢查

PCR 直接定序技術是直接使用 PCR 反應的擴增產物為模板，以確定鹼基序列，並未進行複製。這是一種非常有效的方法，能夠迅速取得鹼基序列資訊，減少複製後鹼基採用錯誤的影響。
不過，依 PCR 的擴增情況而定，分析結果可能出現很大的差異。要提高成功率，在定序反應之前必須確認 PCR 產物的純度 (品質及含量)。過去確認步驟都是以瓊脂膠體電泳進行，
不過某些情況下，定序分析得到的序列資料，顯示有可能存在密切相關的反應受質，甚至只有單一目標 PCR 產物的時候。之所以出現這種情況，一個可能的原因是瓊脂膠體電泳的靈敏度不足，使用這種方法難以說明主要反應產物中，是否含有微量的 PCR 反應副產物。
此處我們說明 PCR 直接定序的 PCR 產物純度分析，這是日本岡山縣農林水產科學技術中心生物科學研究所，為探索十字花科植物科的管家基因而使用的技術。

使用瓊脂膠體電泳測得的各種 PCR 產物，大小大致相同，差異並不大。在 MultiNA 的電泳結果中，可在Westar 樣品中測得一個反應副產物，這在膠體影像模式中可以被注意到，而在電泳圖模式中，DNA呈現明顯的峰。不過，瓊脂膠體電泳並未檢測到反應副產物。

使用 MultiNA，可依據電泳圖模式的峰面積計算濃度，此數值足以進行定序反應。因此，MultiNA 對於 PCR 產物純度分析非常有用，是 PCR 直接定序流程的重要工具。

Microchip Electrophoresis System for DNA/RNA

使用微晶片的電泳系統，依大小分離 DNA 和 RNA 樣品，因此可以確認核酸 (DNA/RNA) 樣品大小並大致定量。微晶片電泳系統可快速進行電泳分離，螢光檢測器則確保分析的高靈敏度，此外並可全自動完成作業。