使用 MALDI-TOF MS/蛋白質定序儀進行 N 端胺基酸定序分析

質譜儀已成為研究人員進行胜肽定序時不可或缺的工具。源內裂解 (ISD) 定序雖然在許多情況下有效提供序列訊息,但由時候也會遇到一些挑戰,包括同重胺基酸、依賴資料庫、低分子量干擾等。
傳統 Edman 定序是依序分析 N 端的每個胺基酸,無需依賴質量或使用資料庫。可惜的是,Edman 在提供高序列覆蓋率方面,本身也有其限制。
在本技術報告中,以 MALDI-8020 (ISD) 取得完整質量和定序資訊,並以 PPSQ-50A 梯度系統 (Edman法) 取得 N 端序列,探討兩者併用的效益。研究人員利用這些綜合資訊,可深入瞭解關注的蛋白質及胜肽。

Fig. 1 Subtracted Chromatograms from First Seven Cycles Using the PPSQ-50A Gradient System

圖 1. 使用 PPSQ-50A 梯度系統分析,前七個循環的去背景層析圖

 
Fig. 2 ISD Spectrum of BNP Using MALDI-8020 with DAN Matrix. MASCOT Identification Shown Inset

圖 2. 使用 MALDI-8020 及 DAN 基質之 BNP 的 ISD 質譜圖。MASCOT 鑑定顯示於插圖。

 
 
 

Benchtop MALDI-TOF MS "MALDI-8020"

Benchtop MALDI-TOF MS "MALDI-8020"

特色:

MALDI-8020 是 Shimadzu 一系列 MALDI-TOF 產品中的產品。這款桌上型線性 MALDI-TOF 質譜儀,機型輕巧而性能優異,對於當今需求越來越高的實驗室,是理想選擇。

蛋白質定序儀

Gradient System

特色:

PPSQ-51A/53A 採用自動化 Edman 降解分析,為研究人員提供可靠及靈敏的 N 端蛋白質定序結果。不論是轉換系統,還是第一次採用這項技術,直覺式軟體及強大的 Shimadzu 硬體可簡化實驗室的蛋白質定序程序。