使用桌上型 MALDI-TOF 質譜儀，以源內裂解進行蛋白質定序分析 : SHIMADZU (Shimadzu Corporation)

MALDI-TOF 質譜儀常用於蛋白質的分子量量測及鑑定。使用質譜儀鑑定蛋白質，在製備時通常需要進行胰蛋白酶消化；然而，如果蛋白質經過分離純化，則可檢測離子源 (ISD，源內裂解) 內碎斷生成的離子，對完整蛋白質進行定序分析，無需使用胰蛋白酶消化蛋白質。
以 MALDI 量測蛋白質分子量時，通常使用含芥子酸酸 (sinapinic acid) 的試劑 (基質)；若以 ISD 進行定序分析，則使用 1,5-二胺萘萘 (1,5-diaminonaphthalene ,DAN) 為基質。使用以 ISD 生成的碎片離子檢索資料庫，例如使用 Mascot，可鑑定蛋白質。此外，以碎片離子質量取得的胺基酸序列資訊，進行同源性檢索，可推斷出與蛋白質資料庫不相符的蛋白質。
本文舉例說明使用桌上型 MALDI-TOF 質譜儀「MALDI-8020」量測蛋白質分子量，並以 ISD進行蛋白質定序分析。

蛋白質分子量的量測範例

將 250 fmol (約 17 ng) 牛血清白蛋白 (BSA) 混合芥子酸 (10 mg/mL，50% 乙腈/0.1% 三氟乙酸溶液)，使用 MALDI-8020 以線性模式進行分析，結果如圖 1 所示。在 m/z 66,430 處測得 BSA 的單電荷質子化分子峰，S/N > 100。

Fig. 2 Mass Spectrum of a Trace Amount of Protein (Bovine Serum Albumin)

圖 1. 微量蛋白質 (牛血清白蛋白) 之質譜圖

詳細資訊

Benchtop MALDI-TOF MS "MALDI-8020"

主要特點：

線性模式 (正離子) MALDI-TOF
200 Hz 固態雷射，355 nm
樣品承載室快速導入樣品
UV 雷射離子源清潔功能 (專利)
桌上型設計
運轉低噪音 (<55 dB)