轉譯後修飾分析 | 以 LCMS-IT-TOF 進行糖鏈結構分析

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轉譯後修飾分析

以 LCMS-IT-TOF 進行糖鏈結構分析

■ 市售小鼠單株抗體的分析

糖鏈 (又稱為「生命第三鏈」) 分子可提供豐富的生物資訊，越來越受到重視. 對於細胞間訊息傳遞、分子辨識等生物現象，糖鏈具有重要作用，且已知與癌症、慢性疾病、傳染病、免疫功能、大腦、發育異常、退化等有關。
質譜儀的性能日益提升，過去非常費時的高通量糖鏈結構分析，現在已更容易進行。

以下說明市售小鼠單株抗體的分析。
測試及研究流程
1) 使用 SDS-PAGE，從膠體切下抗體的對應條帶。
2) 使用 PNGaseF 進行膠體內消化。
3) 使用 BlotGlyco 試劑組 (Sumitomo Bakelite) 純化並標記糖鏈。
4) 使用 Prominence nano 及 LCMS-IT-TOF 進行MS n 分析。

圖 1 顯示 m/z696.7672,m/z769.2833,m/z850.3369, andm/z930.9525 的質譜層析圖。

圖 1. Prominence nano / LCMS-IT-TOF 質譜層析圖

圖 2 至圖 5 顯示來自圖 1 質譜層析圖母離子的 MS/MS 質譜圖。圖中的糖鏈結構，是以糖鏈結構預測軟體推估的結果。

High-Performance Liquid Chromatograph Mass Spectrometer

  • LCMS-IT-TOF 高效液相層析質譜儀可生成質量準確度絕佳的 MS n 資訊，是糖鏈分析的理想選擇。
  • Prominence nano Nanoflow 高效液相層析儀搭配 NES-100 NanoESI 界面，可提供高靈敏度的糖鏈分析。
  • LCMS-IT-TOF 優異的質量準確度，可進行高度準確的糖鏈推估。
  • 中性丟失調查可自動評估 MS 2圖譜中預設的特定中性丟失，並執行 MS 3 量測。
  • 專用軟體為糖鏈結構分析提供有力的支援。