轉譯後修飾分析 | 以 MSn 進行糖鏈結構分析

收藏

使用 MS6 數據分析醣肽

以下說明 Asn 連結型糖鏈的 MS n 結構分析。
以 MS 質譜圖中的 [M+Na] +(m/z1999.8) 分子離子峰為母離子，所獲得的 MS/MS 質譜圖，在交叉環裂解的 O,2A6離子 ( m/z1562.6) 出現最強訊號。不過在此階段，MS/MS 測得的產物離子極少，無法取得足夠的糖鏈序列資訊。

圖 1. 10 BP 之 MS 與 MS/MS 圖譜

If an MSn若使用 O,2An 離子為前驅物離子取得 MSn 圖譜，預計可觀察到 [M-60] +(2,4An離子) 和 [M-120] +(Bn-1離子) 的強訊號。(請參見 AXIMA QIT Application No. 4。)
隨後n ，使用 m/z1562.6 為母離子，以 MSn 進行糖鏈定序分析。

圖 2. 10 BP 之 MS n（MS3 to MS6）圖譜

使用 O,2 A6 離子 (m/z 1562.6) 為母離子，所獲得的 MS3 圖譜，一如預期可觀察到 2,4A6 離子 (m/z 1502.6) 和 B5 離子 (m/z 1442.6)。同樣的，以 B5 離子 (m/z 1442.6) 為母離子獲得的 MS4 圖譜，也測得含有雙醣至七醣的子離子。
進一步執行 m/z 1077.5 的 MS5 分析和 m/z 712.3 的 MS6 分析，以觀察單醣 ([Hex or GlcNAc + Na] +) 訊號。這樣的程序可從 MS n 圖譜取得大量的糖鏈結構資訊。

樣品由橫濱市立大學國際綜合科學部 Yasuhiro Kajihara 博士提供

MALDI-TOF Mass Spectrometry

  • Prominence nano LC 能夠進行高靈敏度的糖鏈分析，其獨特的回流流量控制系統可增強分離再現性，專用的 Nano-Assist 軟體則可簡化自動化及參數設定。
  • AccuSpot 可自動加入基質，並將 Prominence nano 系統分離出的糖鏈分注點在 MALDI 樣品盤上。
  • 使用 Prominence nano 對糖鏈混合物進行分離及純化，可降低雜質的離子抑制程度。
  • 分析軟體為糖鏈結構分析提供有力的支援。