生物標記探索 | 以 LCMS-IT-TOF 及分析軟體分析已改變的蛋白質成分

使用 LCMS-IT-TOF 及分析軟體分析已改變的蛋白質成分

生物體的蛋白質表現，已知會因癌症或其他疾病而出現特定改變。
有多種不同的方法可以檢測蛋白質的定量及定性變化。
其中一種方法是以奈米流速 LC 分離胜肽成分，並使用 LCMS-IT-TOF 質譜儀搭配統計分析軟體，分析鑑定已改變的成分。這個分析方法說明如下。

有添加/未添加BSA之酵母菌萃取蛋白質，於主成分分析的結果中，在主成分軸 (PC1) 可看到明確的分群結果，判斷是來自加入 BSA 的胜肽。

透過軟體，在多變項分析中 (例如主成分分析) 可以僅選擇出現顯著變化的成分。
此方法可有效檢測並鑑定有變化的成分，無需使用穩定同位素標記或完整鑑定所有的成分。

LCMS-IT-TOF Liquid Chromatograph Mass Spectrometer
常規 2D 電泳需要複雜的手動操作，難以達到自動化，而結合 Prominence 奈米級奈流 LC 和 LCMS-IT-TOF 液相層析質譜儀的系統，則可實現高度再現性的分離分析。此系統內建 Nano-Assist 專用控制軟體，能夠簡化分析條件的設定，達到自動化操作。此外，利用專用的奈米 ESI 界面可進行高靈敏度的蛋白質分析，適用於分析高疏水性或鹼性蛋白質，以及各種分子量大小、難以利用電泳分離的蛋白質。

代謝體分析軟體

Profiler^TM AM⁺ 代謝體分析軟體可以對來自質譜儀獲得的海量數據進行統計分析。它可以對兩個或多個樣本族群 (樣品集) 進行比較和統計疊加，以確定對樣本族群 (樣品集) 之間差異影響最大的代謝物。
Profiler^TM AM⁺ 可以透過比較樣本族群 (樣品集) 進行主成分分析 (PCA) 和聚類分析，是從大量數據中搜索表現出特徵變化的成分 (候選生物標誌) 的理想選擇。
請參閱 MetIDSolution Metabolite Structural Analysis Software 代謝物結構分析軟體，了解代謝物的高通量、全面檢測和鑑定。

Profiling Solution

利用代謝體學方法，釐清代謝路徑及控制機轉，能夠針對巨量樣品或化合物取得的複雜資料檔案，找出其中的差異，為學術研究及應用領域 (包括製藥、食品、環境) 提供有力的工具。