Multi-omics Analysis Package

多體學分析套件

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Multi-omics Analysis Package

 

Multi-omics Analysis Package 是代謝工程軟體，可根據代謝組學、蛋白質組學、通量分析等領域產生的大量質譜數據，並自動生成代謝圖譜，進行多種數據分析。結合島津為代謝組學分析提供的各式方法包和資料庫，多體學分析方法包可以幫助提高代謝組學數據分析工作的效率。數據直觀的視覺化可為藥物開發、食品功能增強、生物工程和其他生命科學研究應用等，提供了強大的支援。

簡單操作在代謝圖譜上，視覺化呈現化合物的數量變化

該軟體大幅節省繪製測量數據或將其標示在代謝圖譜上所需的作業流程。

 

簡單操作識別重要的化合物

可簡單使用 volcano plots 來比較兩組資料，主成分分析 (PCA) 或階層式分群法 (HCA) 結果或箱形圖。鏈接的 PCA、HCA 和箱形圖結果可以顯示在同一視窗中，以方便識別重要的化合物。可以放大代謝圖譜以確認已識別的化合物在圖譜上的位置，並支援確認和解釋數據。

 

各式方法包兼容的視覺化模板

這些模板能與 Shimadzu 的各式方法包結合使用。這些軟體包中包含樣品前處理方法和分析條件等「即用型方法」，用戶從質譜分析到數據分析整個過程都能輕鬆執行。特別是這些視覺化模板（代謝圖譜）與初級代謝物、細胞培養分析、脂質介質和膽汁酸的方法包。模板可以按原樣使用，也可以通過簡單的操作自由設定。

多體學分析套件的流程

Work Flow

 

數據分析工具

 

多體學分析包基於已在 GARUDA 平台上發布的軟體工具 (稱為小工具) - 一個開放的研究平台，由日本系統生物學研究所 (SBI) 領導的 GARUDA 聯盟開發。

GARUDA

 

http://www.garuda-alliance.org/

多體學分析包中使用的數據分析工具

Volcano Plot
結合了 t 檢驗 (統計顯著差異) 和倍數變化 (範例：平均值的差異 (例如 2 倍或 1/2) 可視為兩組之間差異。 Shimadzu 開發的 Volcano Plot 小工具包含在軟體包中。

EasyStats

 

EasyStats
該工具用於可視化主成分分析 (PCA) 或階層式分群法(HCA) 結果或箱形圖 (包括 t-test)。 它可以在一個單獨視窗中顯示代謝物數據分析結果，以便全面地確定特徵變化。

VANTED
由德國康斯坦茨大學維護的工具，可視覺化和分析於不同資料集的網絡。(GARUDA 支援是在澳洲蒙那許大學開發)

Cytoscape
由 Cytoscape Consortium 開發的生物資訊學工具，視覺化代謝途徑、將基因表現譜與相關數據整合等，對於分析網路和視覺化相關性尤其實用。

LC/MS/MS Method Packages Supported by Multi-omics Analysis Package

* 用於初級代謝物和細胞培養分析的 LC/MS/MS 方法包包括多體學分析包的功能。

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多體學分析套件的解決方案
多體學分析套件安裝影片
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